期刊简介
《中华流行病学杂志》前身为1956年创刊的《流行病学杂志》，为流行病学及其相关学科的高级专业学术期刊。以从事预防医学、基础医学、临床医学及流行病 学科研与教学的工作者为读者对象。《中华流行病学杂志》按照理论与实际应用相结合的原则，集中报道国内流行病学领域内重要的科研成果，重视现场流行病学调 查和监测，展现与流行病学相关的实验室科研报告，报道临床流行病学研究，综合反映疾病预防控制工作中的热点和重点问题。
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首页>中华流行病学杂志
- 杂志名称：中华流行病学杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：0254-6450
- 国内刊号：11-2338/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：连续多年被评为百种中国杰出学术期刊、中国精品科技期刊、中国最具国际影响力学术期刊等。期刊收录：万方收录(中), 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 国家图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), CA 化学文摘(美), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
基于大数据的肝癌血管侵袭标志物分析
陈谦；仇小强
关键词：肝癌, 血管侵袭, 标志物, microRNA, 大数据
摘要：目的 通过对GEO (Gene Expression Omnibus)与TCGA (The Cancer Genome Atlas)数据库分析,挖掘肝癌血管侵袭相关的microRNA,并分析其预后和可能机制.方法 利用GEO数据库获得肝癌血管侵袭microRNA芯片数据(GSE67140),对5种侵袭能力不同的细胞系(SNU423、SNU449、HepG2、Hep3B、SNU398)表达谱进行差异分析,并在81份血管侵袭阳性组织样本与91份血管侵袭阴性组织样本中验证差异分析结果.结合TCGA数据库中362例肝癌病例数据分析其预后,并对microRNA所调控的基因进行GO与KEGG分析.结果 hsa-mir-1180、hsa-mir-149、hsa-mir-744、hsa-mir-940在侵袭能力强的肝癌细胞和有血管侵袭的肝癌组织中表达上调(logFC＞1,P＜0.05).生存分析显示,hsa-mir-1180 (HR=1.623,95％CI:1.114 ～ 2.365,P=0.012)、hsa-mir-149(HR=2.400,95％CI:1.639 ～ 3.514,P＜0.001)、hsa-mir-744(HR=1.679,95％CI:1.161～2.427,P=0.006)、hsa-mir-940 (HR=1.704,95％CI:1.188 ～ 2.443,P=0.004)是肝癌病例预后独立危险因素,高表达与患者生存期缩短显著相关(P＜0.05).GO与KEGG分析其机制可能与免疫反应、细胞黏附、紧密连接等信号通路有关.结论 通过对TCGA与GEO数据库的挖掘,初步发现hsa-mir-1180、hsa-mir-149、hsa-mir-744、hsa-mir-940对肝癌的预后有影响,可作为肝癌预后的生物标志物.
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