期刊简介
《中华流行病学杂志》前身为1956年创刊的《流行病学杂志》，为流行病学及其相关学科的高级专业学术期刊。以从事预防医学、基础医学、临床医学及流行病 学科研与教学的工作者为读者对象。《中华流行病学杂志》按照理论与实际应用相结合的原则，集中报道国内流行病学领域内重要的科研成果，重视现场流行病学调 查和监测，展现与流行病学相关的实验室科研报告，报道临床流行病学研究，综合反映疾病预防控制工作中的热点和重点问题。
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首页>中华流行病学杂志
- 杂志名称：中华流行病学杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：0254-6450
- 国内刊号：11-2338/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：连续多年被评为百种中国杰出学术期刊、中国精品科技期刊、中国最具国际影响力学术期刊等。期刊收录：万方收录(中), 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 国家图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), CA 化学文摘(美), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
人埃可病毒20型KM/EV20/2010分离株的全基因组序列分析
潘玥；邵聪文；王晓辉；朱艳菊；陈俊英；陈伟；马绍辉；刘建生
关键词：埃可病毒, 全基因组, 序列分析
摘要：目的 对人埃可病毒20型(ECHO20) KM/EV20/2010分离株全基因组进行序列测定,并分析其分子变异和进化特点.方法 设计针对KM/EV20/2010引物,提取病毒RNA,RT-PCR扩增和序列测定获得全基因序列.利用Mega 4.1、RDP3和SimPlot 3.5.1软件分析全基因序列.结果 KM/EV20/2010病毒株基因组全长7 395 bp个核苷酸(nt),5’端和3’端分别为744 nt和96 nt的非编码区,5’和3’非编码区间为一个6 549 nt长的开放阅读框,编码一个含2 183个氨基酸的多聚蛋白,编码区内未见核苷酸的插入或缺失.与GenBank中现有唯一1株ECHO20 JV-l原型株全基因组序列相比对,核苷酸同源性为80.1％,氨基酸同源性为96.7％;构建基于全长VP1基因序列的进化树图并进行基因分型分析,ECHO20可分为6个基因型,中国分离株分属Ⅲ和Ⅳ基因型,其中KM/EV20/2010属于基因型Ⅳ,且6个基因型之间核苷酸的差异为9.4％～21.7％.基于全基因组序列的种系进化分析提示KM/EV20/2010分离株与ECHO20原型株JV-1遗传距离很远,未与原型株JV-1聚簇分布,而与ECHO30病毒株遗传距离较近.分析发现KM/EV20/2010序列在非结构区可能存在重组.结论 中国ECHO20可分为6个基因型,KM/EV20/2010分离株属于Ⅳ基因型.
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