期刊简介

《中华流行病学杂志》前身为1956年创刊的《流行病学杂志》,为流行病学及其相关学科的高级专业学术期刊。以从事预防医学、基础医学、临床医学及流行病 学科研与教学的工作者为读者对象。《中华流行病学杂志》按照理论与实际应用相结合的原则,集中报道国内流行病学领域内重要的科研成果,重视现场流行病学调 查和监测,展现与流行病学相关的实验室科研报告,报道临床流行病学研究,综合反映疾病预防控制工作中的热点和重点问题。

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  • 杂志名称:中华流行病学杂志
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中华医学会
  • 国际刊号:0254-6450
  • 国内刊号:11-2338/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:连续多年被评为百种中国杰出学术期刊、中国精品科技期刊、中国最具国际影响力学术期刊等。期刊收录:万方收录(中), 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 国家图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), CA 化学文摘(美), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
中华流行病学杂志2013年第04期

中国北方部分地区北京谱系结核分枝杆菌群体遗传关系的分析

丁朋举;惠明;梁倩;张乾;李卫民;黄海荣

关键词:结核分枝杆菌, 北京谱系, 系统发育, 分子方差分析, 基因流动, 最小跨度树
摘要:目的 应用分子遗传学方法探讨234株北京谱系结核分枝杆菌的起源进化及群体间基因流动特征.方法 对来源于中国北方五省区(黑龙汀、吉林、辽宁、内蒙古和宁夏)234株北京谱系结核分枝杆菌进行24位点可变数目串联重复序列(VNTR)基因分型,计算各VNTR位点的等位基因多态性(h);从个体水平分析其系统发育,即构建NJ树和小生成树;构建群体水平系统发育树,并在此基础上通过贝叶斯模型计算近共祖年代;通过分子方差分析了解五省区菌株间的基因流动情况.结果 24个VNTR位点的等位基因多态性较低(h值:0.000 ~ 0.744).234株北京谱系结核分枝杆菌分散存在NJ树各个进化分支,小生成树中约62.0%(145/234)的菌株被划分到同一“克隆复合群”.群体水平系统发育树显示234株菌与MIRU-VNTRplus数据库(http://www.miru-vntrplus.org)中的北京谱系结核分枝杆菌的遗传关系近(Bootstrap值为100);近共祖年代为5308年(95%CI:4263 ~ 6470年).通过分子方差分析发现吉林与黑龙江、辽宁菌株之间,内蒙古与宁夏菌株之间遗传分化系数的差异无统计学意义(P>0.05).结论 中国北方五省区北京谱系结核分枝杆菌的遗传相似性较高,菌株间种系发生关系不明显.推测这些菌株由近期(约5000年前)结核分枝杆菌北京谱系的某一“克隆”进化而来.地理位置接近的区域,菌株间存在基因流动现象.