期刊简介
《中华流行病学杂志》前身为1956年创刊的《流行病学杂志》,为流行病学及其相关学科的高级专业学术期刊。以从事预防医学、基础医学、临床医学及流行病 学科研与教学的工作者为读者对象。《中华流行病学杂志》按照理论与实际应用相结合的原则,集中报道国内流行病学领域内重要的科研成果,重视现场流行病学调 查和监测,展现与流行病学相关的实验室科研报告,报道临床流行病学研究,综合反映疾病预防控制工作中的热点和重点问题。
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首页>中华流行病学杂志

- 杂志名称:中华流行病学杂志
- 主管单位:中国科学技术协会
- 主办单位:中华医学会
- 国际刊号:0254-6450
- 国内刊号:11-2338/R
- 出版周期:月刊
期刊荣誉:连续多年被评为百种中国杰出学术期刊、中国精品科技期刊、中国最具国际影响力学术期刊等。期刊收录:万方收录(中), 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 国家图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), CA 化学文摘(美), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
2009年云南省柯萨奇病毒B3型分离株A103/KM/09全基因序列分析
杨卉娟;刘建生;张云昆;马忠飞;赵卫中;潘玥;陈俊英;邵聪文;马绍辉
关键词:柯萨奇病毒B3型, 全基因序列, 序列分析
摘要:目的 分析2009年云南省脑炎患儿粪便标本分离的柯萨奇病毒B3型分离株A103/KM/09全基因序列,了解其遗传特性.方法 设计针对柯萨奇病毒B3型引物,提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得全基因组序列,利用Geneious和Mega 5.05软件进行核苷酸、氨基酸序列比对及其系统进化分析,应用RDP 3和SimPlot 3.5.1重组软件对序列进行重组分析.结果 该分离株全基因组核苷酸序列长度为7389 bp.其核苷酸和氨基酸序列与其原型株Nancy的同源性分别为81.0%和95.7%;与其他柯萨奇病毒B3型毒株的各区段核苷酸和氨基酸同源性分别为81.0%~ 88.0%和95.7%~98.0%;进化分析发现CVB3可分为5个分支(Ⅰ~Ⅴ),核苷酸之间的差异为16.2% ~ 24.3%;中国分离株属Ⅴ分支,又可分为A~D亚分支,核苷酸之间的差异为4.3%~11.4%.并发现A103/KM/09株基因序列在非结构区可能存在重组事件.结论 柯萨奇病毒B3型分为5个基因型,云南分离株A103/KM/09属于Ⅴ-D亚型,而中国分离株已经发生一定进化.
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