期刊简介
《中华流行病学杂志》前身为1956年创刊的《流行病学杂志》，为流行病学及其相关学科的高级专业学术期刊。以从事预防医学、基础医学、临床医学及流行病 学科研与教学的工作者为读者对象。《中华流行病学杂志》按照理论与实际应用相结合的原则，集中报道国内流行病学领域内重要的科研成果，重视现场流行病学调 查和监测，展现与流行病学相关的实验室科研报告，报道临床流行病学研究，综合反映疾病预防控制工作中的热点和重点问题。
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首页>中华流行病学杂志
- 杂志名称：中华流行病学杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：0254-6450
- 国内刊号：11-2338/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：连续多年被评为百种中国杰出学术期刊、中国精品科技期刊、中国最具国际影响力学术期刊等。期刊收录：万方收录(中), 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 国家图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), CA 化学文摘(美), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
2008年柯萨奇病毒A组16型昆明分离株KMM08全基因组序列分析
马绍辉；潘玥；何春艳；陈俊英；施海晶；孙强明；李琦涵
关键词：柯萨奇病毒A组16型, 全基因组, 序列分析
摘要：目的 分析柯萨奇病毒A组16型(CA16)昆明分离株KMM08全基因序列,了解其遗传特性.方法 设计针对CA16引物,提取病毒RNA,RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列.利用Mega 4.1,RDP3和SimPlot 3.5.1等软件分析全基因序列.结果 获得KMM08全基因组核苷酸序列长度为7409bp,编码含2193个氨基酸残基的多聚蛋白；与其他CA16参考株核苷酸和氨基酸同源性分别为79.0％～ 98.2％和94.5％ ～ 99.3％,其中SZ-HK08-3与国际标准株G10核苷酸和氨基酸同源性分别79.1％和94.8％；而与肠道病毒71型(EV71)标准株BrCr同源性分别为78.7％和89.0％.在各个区段上,KMM08与SZ-HK08-3的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.0％～99.0％和98.0％～100.0％,同源性高；与G10的核苷酸和氨基酸同源性分别为74.2％ ～ 86.9％和90.9％ ～97.0％；与EV71 BrCr核苷酸和氨基酸同源性分别在65.0％ ～ 84.9％和71.0％～95.2％.进化分析发现KMM08属于B基因型的一个分支.RDP3和SimPlot 3.5.1软件分析发现Tainan-5079-98序列发现重组信号,而KMM08未发现.结论 KMM08分离株为B基因型；CA16与EV71在非结构区发生重组.
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