期刊简介
《中华流行病学杂志》前身为1956年创刊的《流行病学杂志》，为流行病学及其相关学科的高级专业学术期刊。以从事预防医学、基础医学、临床医学及流行病 学科研与教学的工作者为读者对象。《中华流行病学杂志》按照理论与实际应用相结合的原则，集中报道国内流行病学领域内重要的科研成果，重视现场流行病学调 查和监测，展现与流行病学相关的实验室科研报告，报道临床流行病学研究，综合反映疾病预防控制工作中的热点和重点问题。
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首页>中华流行病学杂志
- 杂志名称：中华流行病学杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：0254-6450
- 国内刊号：11-2338/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：连续多年被评为百种中国杰出学术期刊、中国精品科技期刊、中国最具国际影响力学术期刊等。期刊收录：万方收录(中), 知网收录(中), 上海图书馆馆藏, JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 国家图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), CA 化学文摘(美), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
中国艾滋病病毒1型AE循环重组型毒株env基因的变异和进化分析
梁浩；邢辉；魏民；陈钊；关琪；黄海龙；全宇；陈健平；洪坤学；施侣元；邵一鸣
关键词：人类免疫缺陷病毒, 基因, 变异, 进化, 分子
摘要：目的研究中国艾滋病病毒1型(HIV-1)AE循环重组型(CRF01-AE)毒株env不同基因区序列变异的特点及其与进化压力的关系.方法应用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)对从全国部分省收集来的HIV-1感染者血液样本中的HIV-1 外膜蛋白(env)基因进行扩增和亚型鉴定后,选择34份CRF01-AE重组型HIV-1毒株env基因V3～V4区及其邻近区域的序列进行系统进化树和氨基酸变异分析,并计算和分析氨基酸同义替换(Ks)值和非同义替换(Ka)值及Ks/Ka比值.结果基因系统树显示中国的34份样本CRF01-AE重组型毒株与我国代表株AE.97CNGX2F和泰国代表株AE.CM240、AE.93TH253聚集在一起.氨基酸替换主要发生在C3和V4区,而V3区和V3上游区氨基酸序列相对保守,糖基化位点也比较保守.V3环顶端四肽以GPGQ为主(87.50%).大部分毒株的第306和320位点上没有出现带正电荷的氨基酸.整个V3～V4区的Ks值显著高于Ka值(P＜0.001),且Ks/Ka比值显著高于1(P＜0.001),只有V4区Ks/Ka比值显著低于1(P＜0.01).结论目前多数流行于中国的CRF01-AE重组型HIV-1毒株具有较高的同源性,在进化上关系密切.氨基酸替换主要发生在C3和V4区,而不是V3区.由于大部分毒株的第306和320位点上没有出现带正电荷的氨基酸,推测这些毒株为不引起细胞融合的NSI型,其V3～V4区序列的变异主要受到功能性的限制而与正向选择压力无密切关系,但其中V4区的变异与正向选择压力有关.
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